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LaTeXを使ってサンスクリット語（ラテン文字転写）を出力する簡単な例です．Unicodeでアクセント記号つき文字を入力し，uptexで処理します．アクセント記号つき文字の入力方法については次のページを見てください．
以下の例ではucsパッケージとtipaパッケージを使います．TeX Liveなど比較的新しいTeXのシステムには標準で含まれています．古いシステムの場合は自分でインストールする必要があるかもしれません．あるいは最新のTeX Live（2016年4月現在TeX Live 2015が最新）をインストールしてしまった方が簡単かもしれません．
\documentclass[uplatex]{jsarticle}
\kcatcode`á=15% ラテン1補助（U+0080以降）
\kcatcode`Ā=15% ラテン文字拡張A（U+0100以降）
\kcatcode`ƀ=15% ラテン文字拡張B（U+0180以降）
\kcatcode`Ḁ=15% ラテン文字拡張追加（U+1E00以降）
\usepackage{ucs}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
\usepackage{tipa}
\DeclareUnicodeCharacter{7772}{\textsubdot{\=R}}
\DeclareUnicodeCharacter{7773}{\textsubdot{\=r}}
\begin{document}
\begin{verse}
āsīd rājā, nalo nāma, vīrasenasuto balī,\\
upapanno guṇair iṣṭai, rūpavān, aśvakovidaḥ.
\end{verse}
\end{document}
これを次のように処理します．
$ uplatex input.tex $ dvipdfmx input.dvi
入力は「ṛ」とするが，出力は「r̥」にしたい，という場合，次のようにします．古典サンスクリット語の場合と比べて\DeclareUnicodeCharacterの行が変わっていますので注意してください．
\documentclass[uplatex]{jsarticle}
\kcatcode`á=15% ラテン1補助（U+0080以降）
\kcatcode`Ā=15% ラテン文字拡張A（U+0100以降）
\kcatcode`ƀ=15% ラテン文字拡張B（U+0180以降）
\kcatcode`Ḁ=15% ラテン文字拡張追加（U+1E00以降）
\usepackage{ucs}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
\usepackage{tipa}
\DeclareUnicodeCharacter{7770}{\textsubring{R}}
\DeclareUnicodeCharacter{7771}{\textsubring{r}}
\DeclareUnicodeCharacter{7772}{\textsubring{\=R}}
\DeclareUnicodeCharacter{7773}{\textsubring{\=r}}
\begin{document}
\begin{verse}
atha tāṁ, vayasi prāpte, dāsīnāṁ samalaṁkṛtam\\
śataṁ, śataṁ sakhīnāṁ ca, paryupāsac, chacīm iva.
\end{verse}
\end{document}
入力も出力も「r̥」にするにはファイルを変換するか，ucsのcombineオプションを有効にする必要がありますが，ここでは省略します．
古典サンスクリット語の場合と同様です．
\documentclass[uplatex]{jsarticle}
\kcatcode`á=15% ラテン1補助（U+0080以降）
\kcatcode`Ā=15% ラテン文字拡張A（U+0100以降）
\kcatcode`ƀ=15% ラテン文字拡張B（U+0180以降）
\kcatcode`Ḁ=15% ラテン文字拡張追加（U+1E00以降）
\usepackage{ucs}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
\usepackage{tipa}
\DeclareUnicodeCharacter{7772}{\textsubdot{\=R}}
\DeclareUnicodeCharacter{7773}{\textsubdot{\=r}}
\begin{document}
\begin{verse}
agním īḷe puróhitaṃ,\\
yajñásya devám ṛtvíjam,\\
hótāraṃ ratnadh\textacutemacron{a}tamam.\\
\end{verse}
KṚ-, kṛ-, KṜ-, kṝ-.
\end{document}
ā́（長くて鋭アクセントの置かれたa）などはそのまま入力しても処理できないので，ファイルを変換するか，ucsのcombineオプションを有効にする必要があります．少し難しい操作が必要なので，ここではtipaパッケージの記法（\textacutemacron）を用いました．
