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もちろん Adobe Acrobat を使えばできますが、ここでは無償のソフトでそれを実現することを考えます。
Mac OS X 専用ですが、Skim を使うのがもっとも簡単だと思われます。ただし、Skim の場合は思った通りに余白を切り取ってくれないことがあるので、その場合は手作業で Bounding Box を求めて LaTeX か ImageMagick で切り取るしかないでしょう。また、文字などが書かれている部分も切り取るためには、やはり LaTeX か ImageMagick を使うことになるでしょう。
